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馬英九總統昨晚接受udn tv全球瞭望節目主持人郭崇倫專訪表示，關於遴選中研院新院長問題，「既已啟動過程，就不能停下來」；他除希望本周能跟候選人見面，並指已聲明退出的郭位院士也將在約訪之列；如時間允許，即會與準總統蔡英文會商，決定新院長人選。

馬總統也說明為何無法退回中研院遴選案的原因，指大家的共識是雖有瑕疵、卻也未到退回程度；不過馬要「郭位重新入列」，又讓中研院新院長人事再掀另波高潮。

馬總統說，他已注意到項武忠等院士與國內主張退回名單的聲音，但院內還是有不同看法，可見在中研院內部還沒形成共識。另一方面，總統府、中研院以及行政院人事部門都仔細研究過，遴選過程是否瑕疵大到必須要退回？最後大家的共識是「有瑕疵，但好像沒這麼嚴重」。

馬總統解釋，遴選委員會改變投票制度，當天在現場提出來討論後，六十七人有六十五人贊成，另兩位廢票，在這種情況下，可能還沒有到達退回的條件，總統府也不能違法做決定。

他表示，既然不退回，就應該把中研院推薦的三個人選請回台灣，並與他們當面交換意見，然後再來做決定;時間允許的話他會跟下一任總統當選人商量、交換意見，請教她，然後再決定。如果時間實在不夠，也許不是由他做決定，「無論tshirt如何，開始啟動這個過程後就不能停下來。已約到兩位，希望能在本周與他們見面。

郭崇倫追問，聲明退出的郭位是否也在其中？馬總統回應，「郭位還是要約，因為中研院送來的名單是三位」；而且郭位退出是在投票後，而中研院也認定投票是有效的、不能隨便把他名字拿掉，「所以我目前還是三個名單」。

馬總統也回應關於為何此時准中研院長翁啟惠請辭，他表示，翁先前已經辭職了、後來是在請辭待命狀態，因翁當時是說擔心辭職恐造成混亂，並沒有說不辭，「我的解讀是請辭待命狀態」，因此在九日作出准辭決定， 並於十日派秘書長曾永權告訴翁，翁也接受。

馬總統說，如翁啟惠沒說清楚、沒法跟社會交代，因此他第一時間是請翁說清楚後再處理其進退問題。後來又陸續有檢調約談搜索、翁涉案情況深等情事，因此更要審慎；等大家都認為翁院長該離開時，就沒有太大阻力，「 時間是較久一點，但過程相當平順。」

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